L’INSAH comprend :
1. Le Directeur Général ;
2. Le Département Etudes et Recherche sur les intrants agricoles, la protection des végétaux et règlementations (DRIAPVR) ;
3. Le Département Etudes et recherche Population, genre, autonomisation des femmes et des jeunes, dividende démographique et développement (CERPOD) ;
4. Le Département Etudes et recherche sur l’Agriculture et la sécurité alimentaire et nutritionnelle (DASAN) ;
5. Le Département Etudes et recherche sur la dynamique et sur les marchés et systèmes d’informations (DMSIM) ;
6. Le Département Etudes et recherche sur les ressources naturelles, l’environnement et les changements climatiques (DRNEC) ;
7. L’Unité Administration, finances et comptabilité (U-AFC) ;
8. L’Unité Communication, Information et Documentation U-CID) ;
9. L’Unité Gestion des Ressources Humaines (U-GRH) ;
10. L’Unité Suivi-Evaluation (U-SE) ;
11. L’Unité Coordination Scientifique (U-CS) ;
12. L’Unité de passation des marchés (U-PM).